Založen již v roce 1908, se zeleným trojlístkem ve znaku a velmi slavnou historií. Pod hlavičkou Panathinaikosu, jenž je odvěkým rivalem pro Olympiakos Pireus, se hraje nejen fotbal, ale i basketbal, volejbal či vodní pólo. Panathinaikos Athény založil Giorgos Kalafatis, hraje na olympijském stadionu s kapacitou 69 618 diváků a v novém tisíciletí mu už hrozil zánik – od roku 2012 vlastní kontrolní balík akcií sdružení fanoušků, kteří klub hrající v bílé a zelené barevné kombinaci zachránili od úpadku.
Panathinaikos koučoval mezi léty 2004 a 2005 Zdeněk Ščasný, v sedmdesátých letech seděl na klubové lavičce slavný Ferenc Puskás, mezi týmové legendy můžeme zařadit třeba Antoniose Nikopolidise, Giourkase Seitaridise, Aljošu Asanoviče, Paola Sousu nebo také Djibrila Cissého, nejlepším střelcem historie klubu je polský útočník Krzysztof Warzycha, pětkrát pak ovládl střelecké tabulky domácí ligové soutěže v tomto dresu Antonis Antoniadis. Dvacetinásobný vítěz řecké první ligy, finalista PMEZ v roce 1971, čtvrtfinalista Poháru UEFA v letech 1988 a 2003. Osmnáct dalších trofejí si tým z Athén připsal v národním poháru.
